Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vma21Q78T54 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms