Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms