Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eci3Q78JN3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eci3Q78JN3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eci3Q78JN3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Eci3Q78JN3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms