Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd3eapQ76KJ5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms