Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv1Q704Y3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms