Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms