Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Efr3bQ6ZQ18 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efr3bQ6ZQ18 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efr3bQ6ZQ18 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efr3bQ6ZQ18 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Efr3bQ6ZQ18 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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Efr3bQ6ZQ18 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Efr3bQ6ZQ18 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Efr3bQ6ZQ18 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Efr3bQ6ZQ18 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Efr3bQ6ZQ18 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Efr3bQ6ZQ18 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Efr3bQ6ZQ18 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Efr3bQ6ZQ18 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Efr3bQ6ZQ18 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Efr3bQ6ZQ18 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Efr3bQ6ZQ18 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Efr3bQ6ZQ18 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efr3bQ6ZQ18 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
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