Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms