Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M2Q6W9L1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M2Q6W9L1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms