Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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