Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT7

Ccsmst1, Protein CCSMST1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsmst1Q6RUT7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccsmst1Q6RUT7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccsmst1Q6RUT7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms