Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HjurpQ6PG16 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms