Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkab2Q6PAM0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab2Q6PAM0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms