Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms