Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atl2Q6PA06 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms