Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga3Q6NZL0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms