Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms