Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf6Q6NVF9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms