Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frem2Q6NVD0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms