Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil1Q6EDY6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Carmil1Q6EDY6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Carmil1Q6EDY6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms