Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scaf8Q6DID3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms