Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrcc1Q69ZB0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms