Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sbno1Q689Z5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sbno1Q689Z5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
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