Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp9bQ66X22 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms