Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms