Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q66JV7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q66JV7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q66JV7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q66JV7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q66JV7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q66JV7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q66JV7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q66JV7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q66JV7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q66JV7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q66JV7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q66JV7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q66JV7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q66JV7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q66JV7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q66JV7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q66JV7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q66JV7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q66JV7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q66JV7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q66JV7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q66JV7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q66JV7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q66JV7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q66JV7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q66JV7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q66JV7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q66JV7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q66JV7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q66JV7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q66JV7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q66JV7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q66JV7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q66JV7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q66JV7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q66JV7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q66JV7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q66JV7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms