Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VclQ64727 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VclQ64727 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VclQ64727 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VclQ64727 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VclQ64727 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VclQ64727 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VclQ64727 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VclQ64727 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VclQ64727 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VclQ64727 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VclQ64727 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VclQ64727 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VclQ64727 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VclQ64727 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VclQ64727 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VclQ64727 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VclQ64727 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VclQ64727 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VclQ64727 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VclQ64727 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VclQ64727 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VclQ64727 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms