Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clcn1Q64347 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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Clcn1Q64347 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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Clcn1Q64347 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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Clcn1Q64347 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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Clcn1Q64347 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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Clcn1Q64347 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn1Q64347 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn1Q64347 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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