Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Lcn4Q62472 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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