Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vil1Q62468 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms