Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nptx1Q62443 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms