Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox19Q62249 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox19Q62249 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms