Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp1Q62209 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp1Q62209 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms