Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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