Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PtprrQ62132 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprrQ62132 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PtprrQ62132 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PtprrQ62132 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PtprrQ62132 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PtprrQ62132 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PtprrQ62132 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprrQ62132 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms