Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Odf1Q61999 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Odf1Q61999 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Odf1Q61999 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Odf1Q61999 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Odf1Q61999 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Odf1Q61999 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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