Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt33bQ61897 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms