Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Lrrn1Q61809 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Lrrn1Q61809 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Lrrn1Q61809 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Lrrn1Q61809 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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Lrrn1Q61809 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrn1Q61809 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrn1Q61809 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrn1Q61809 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrn1Q61809 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn1Q61809 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Lrrn1Q61809 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Lrrn1Q61809 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Lrrn1Q61809 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Lrrn1Q61809 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms