Protein–RNA interactions for Protein: Q61686

Cbx5, Chromobox protein homolog 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx5Q61686 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx5Q61686 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx5Q61686 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms