Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1eQ61290 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms