Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinQ61043 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinQ61043 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinQ61043 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinQ61043 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinQ61043 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinQ61043 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinQ61043 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinQ61043 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NinQ61043 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinQ61043 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NinQ61043 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinQ61043 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinQ61043 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinQ61043 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinQ61043 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinQ61043 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinQ61043 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinQ61043 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinQ61043 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinQ61043 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NinQ61043 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinQ61043 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinQ61043 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinQ61043 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinQ61043 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinQ61043 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinQ61043 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NinQ61043 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NinQ61043 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinQ61043 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinQ61043 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinQ61043 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinQ61043 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NinQ61043 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NinQ61043 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NinQ61043 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinQ61043 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinQ61043 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NinQ61043 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinQ61043 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinQ61043 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NinQ61043 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NinQ61043 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinQ61043 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinQ61043 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NinQ61043 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinQ61043 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NinQ61043 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinQ61043 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinQ61043 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinQ61043 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinQ61043 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinQ61043 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NinQ61043 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinQ61043 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinQ61043 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinQ61043 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinQ61043 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinQ61043 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinQ61043 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinQ61043 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinQ61043 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinQ61043 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinQ61043 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinQ61043 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinQ61043 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinQ61043 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinQ61043 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinQ61043 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinQ61043 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinQ61043 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinQ61043 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinQ61043 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NinQ61043 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NinQ61043 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NinQ61043 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NinQ61043 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NinQ61043 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinQ61043 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinQ61043 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinQ61043 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NinQ61043 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinQ61043 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinQ61043 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinQ61043 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinQ61043 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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