Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms