Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms