Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms