Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms