Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn2cQ60772 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms