Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms