Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc27a1Q60714 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms