Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms