Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sik1Q60670 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik1Q60670 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms